I. Propriétés générales des enzymes
.. A. Définition du pouvoir catalytique
..... 1. Comparaison des chemins réactionnels non catalysés ou catalysés
..... 2. Exemple de la triose-P-isomérase
..... 3. Unités de mesure de l’activité enzymatique
.. B. Les enzymes sont doublement spécifiques
..... 1. Spécificité de réaction
..... 2. Spécificité de substrat
.. C. Classification des enzymes et exemples
..... 1. Oxydo-réductases (dont deshydrogénases)
..... 2. Transférases (dont kinases)
..... 3. Hydrolases (dont protéases, lipases, estérases...)
..... 4. Lyases (dont aldolases)
..... 5. Isomérases
..... 6. Ligases (dont synthétases)
.. D. Intervention et structure des cofacteurs enzymatiques
..... 1. Coenzymes d’oxydo-réduction
........ a. NAD et NADP
........ b. FMN et FAD
........ c. Hèmes à Fer
..... 2. Coenzymes de transferts de groupe
........ a. Coenzyme A
........ b. Diversité des autres coenzymes
.. E. Influence de certains facteurs réactionnels
..... 1. Effet de la température
........ a. Augmentation de la vitesse de réaction avec la température
........ b. Effet de la dénaturation protéique par l’excès de chaleur
..... 2. Effet du pH
........ a. Etude de l’ionisation des histidines catalytiques de la ribonucléase selon le pH
........ b. Diversité des intervalles de pH optimaux
II. Le site actif enzymatique : lieu clé de la catalyse
.. A. Structure et caractéristiques du site actif
..... 1. Etude de l’hexokinase (diffraction X) et comparaison des lysozymes d’oiseaux (anticorps)
..... 2. Bilan : caractéristiques du site actif
........ a. Petit et profond
........ b. Généralement anhydre
........ c. Tridimensionnellement complémentaire de S
.... 3. Modèles de Fischer et de Koschland
.. B. Mécanisme moléculaire de la catalyse (un seul exigible)
..... 1. La navette à protons de la ribonucléase pancréatique
..... 2. Cas des protéases à sérine : la chymotrypsine
III. Les réactions du métabolisme sont contrôlées par les cinétiques enzymatiques
.. A. Les enzymes michaeliennes
..... 1. Rappel : qu’est-ce que l’ordre d’une réaction ?
..... 2. Ordre des réactions enzymatiques et hypothèses de l’équilibre et de l’état stationnaire
..... 3. Modèle de Michaelis et Menten et conséquences
..... 4. Interprétation graphique de l’équation de Michaelis et Menten
..... 5. Autres représentations graphiques : linéaristation de l’équation
..... 6. Inhibitions des enzymes michaeliennes
........ a. Inhibiteurs compétitifs agissant sur Km seul
........ b. Inhibiteurs non compétitifs agissant sur Vmax seule
........ c. Inhibiteurs mixtes agissant simultanément sur Km et Vmax
........ d. Inhibiteurs incompétitifs rares se fisant sur ES
........ e. Inhibition par excès de substrat
........ f. Inhibition fréquente par excès de produit
.. B. Cas des enzymes allostériques
..... 1. Organisation des réactions métaboliques en chaînons
..... 2. Application du modèle de Koschland aux enzymes multimériques
..... 3. Exemple de la phosphofructokinase
.. C. Régulation de l’activité enzymatique
..... 1. Modification de l’enzyme par liaison covalente (phosphorylation)
..... 2. Activation par clivage protéolytique
..... 3. Régulation par l’expression génétique
..... 4. Cas des enzymes multifonctionnelles
Répondre à cet article